El Profesor Dr. Dr. Carlos Jiménez Piernas es titular desde el año 1999 de la Cátedra Jean Monnet de Integración Europea. En el marco de esta Cátedra Jean Monnet, integrada junto con el Centro de Excelencia sobre Integración Regional en el Instituto de Estudios Latinoamericanos de la Universidad de Alcalá, se han dirigido tesis doctorales y organizado variadas actividades académicas destinadas a los estudiantes de grado y posgrado de la Facultad de Derecho, relacionadas con el estudio del proceso de integración europea.

Entre las tesis doctorales dirigidas por el titular de la Cátedra Jean Monnet, destacan:

Profa. Dra. Elena Crespo Navarro, "La erosión de la condición del vínculo de la nacionalidad en la protección del individuo. Especial referencia a la práctica europea". La tesis fue defendida en 2005 y obtuvo la calificación de sobresaliente cum laude por unanimidad. A partir de la misma se publicó una monografía en la editorial Tirant Lo Blanch en el año 2006.

Prof. Dr. Orlando Mejía Herrera, "La Unión Europea como modelo de integración: análisis comparativo del Sistema de la Integración Centroamericana",. La tesis fue defendida en 2006 y obtuvo la calificación de sobresaliente cum laude por unanimidad. A partir de la misma se publicó una monografía en el Servicio de Publicaciones de la Universidad de Alcalá en el año 2008.

Prof. Dr. Bjorn Arp, "La noción de minoría nacional y los mecanismos de protección del Derecho de minorías nacionales en Europa", defendida en 2006 y obtuvo la calificación de sobresaliente cum laude por unanimidad, así como el título de Doctor Europeo. A partir de la misma se publicó una monografía en la editorial Centro de Estudios Políticos y Constitucionales en el año 2008.

Prof. Dr. Francisco José Pascual Vives, "El Derecho de los Tratados en la jurisprudencia comunitaria", defendida en 2007 y obtuvo la calificación de sobresaliente cum laude por unanimidad. A partir de la misma se publicó una monografía en la editorial Tirant Lo Blanch en el año 2009.

Profa. Dra. Carmen Antón Guardiola, "El contencioso hispano-británico sobre Gibraltar: un desafío para la Unión Europea", defendida en 2007 y obtuvo la calificación de sobresaliente cum laude por unanimidad. A partir de la misma se publicó una monografía en la editorial Tirant Lo Blanch en el año 2011.