El Centro de Excelencia en Integración de la Universidad de Alcalá coordina el Máster en Integración Regional en colaboración con el Centro Interuniversitario para Estudios en Integración (CIPEI) de la UNAN-León en Nicaragua.

El CIPEI es una asociación científica regida por unos estatutos aprobados por resolución rectoral de la UNAN-León y que cuenta con tres órganos de dirección y administración.

A fin de promover la enseñanza, formación, capacitación e investigación en materia de integración regional desde un punto de vista interdisciplinario, el CIPEI, de acuerdo a sus órganos de dirección, puede organizar o colaborar en la organización de congresos, seminarios, cursos o programas de postgrado, así como la realización en equipo de trabajos de investigación, siempre y cuando se cuente con el apoyo financiero necesario.

Son miembros del CIPEI diversos especialistas y expertos en integración regional (juristas, politólogos, economistas, filósofos e historiadores) de Centroamérica, el Caribe y España.